Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms