Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW1

COL22A1, Collagen alpha-1(XXII) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL22A1Q8NFW1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
COL22A1Q8NFW1 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
COL22A1Q8NFW1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
COL22A1Q8NFW1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
COL22A1Q8NFW1 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
COL22A1Q8NFW1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
COL22A1Q8NFW1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
COL22A1Q8NFW1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COL22A1Q8NFW1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
COL22A1Q8NFW1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
COL22A1Q8NFW1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
COL22A1Q8NFW1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
COL22A1Q8NFW1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC28■■■□□ 2.07
COL22A1Q8NFW1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
COL22A1Q8NFW1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COL22A1Q8NFW1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COL22A1Q8NFW1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COL22A1Q8NFW1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COL22A1Q8NFW1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
COL22A1Q8NFW1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
COL22A1Q8NFW1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
COL22A1Q8NFW1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
COL22A1Q8NFW1 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
COL22A1Q8NFW1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
COL22A1Q8NFW1 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
COL22A1Q8NFW1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL22A1Q8NFW1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL22A1Q8NFW1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
COL22A1Q8NFW1 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL22A1Q8NFW1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL22A1Q8NFW1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL22A1Q8NFW1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL22A1Q8NFW1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL22A1Q8NFW1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL22A1Q8NFW1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL22A1Q8NFW1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL22A1Q8NFW1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL22A1Q8NFW1 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
COL22A1Q8NFW1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL22A1Q8NFW1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL22A1Q8NFW1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL22A1Q8NFW1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL22A1Q8NFW1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL22A1Q8NFW1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL22A1Q8NFW1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL22A1Q8NFW1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL22A1Q8NFW1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL22A1Q8NFW1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL22A1Q8NFW1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
COL22A1Q8NFW1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL22A1Q8NFW1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL22A1Q8NFW1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL22A1Q8NFW1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL22A1Q8NFW1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL22A1Q8NFW1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL22A1Q8NFW1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL22A1Q8NFW1 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
COL22A1Q8NFW1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL22A1Q8NFW1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
COL22A1Q8NFW1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL22A1Q8NFW1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL22A1Q8NFW1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL22A1Q8NFW1 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL22A1Q8NFW1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms