Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9U0

TC2N, Tandem C2 domains nuclear protein, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TC2NQ8N9U0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TC2NQ8N9U0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TC2NQ8N9U0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TC2NQ8N9U0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TC2NQ8N9U0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TC2NQ8N9U0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TC2NQ8N9U0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TC2NQ8N9U0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TC2NQ8N9U0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TC2NQ8N9U0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TC2NQ8N9U0 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TC2NQ8N9U0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TC2NQ8N9U0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TC2NQ8N9U0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TC2NQ8N9U0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TC2NQ8N9U0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TC2NQ8N9U0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TC2NQ8N9U0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TC2NQ8N9U0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TC2NQ8N9U0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TC2NQ8N9U0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TC2NQ8N9U0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TC2NQ8N9U0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TC2NQ8N9U0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TC2NQ8N9U0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TC2NQ8N9U0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TC2NQ8N9U0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TC2NQ8N9U0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms