Protein–RNA interactions for Protein: Q86UC2

RSPH3, Radial spoke head protein 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH3Q86UC2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms