Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT27Q7Z3Y8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT27Q7Z3Y8 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT27Q7Z3Y8 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT27Q7Z3Y8 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT27Q7Z3Y8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT27Q7Z3Y8 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT27Q7Z3Y8 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT27Q7Z3Y8 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT27Q7Z3Y8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT27Q7Z3Y8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT27Q7Z3Y8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT27Q7Z3Y8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT27Q7Z3Y8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT27Q7Z3Y8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT27Q7Z3Y8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT27Q7Z3Y8 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT27Q7Z3Y8 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT27Q7Z3Y8 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT27Q7Z3Y8 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT27Q7Z3Y8 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT27Q7Z3Y8 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT27Q7Z3Y8 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT27Q7Z3Y8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT27Q7Z3Y8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT27Q7Z3Y8 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT27Q7Z3Y8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT27Q7Z3Y8 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT27Q7Z3Y8 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT27Q7Z3Y8 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT27Q7Z3Y8 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT27Q7Z3Y8 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT27Q7Z3Y8 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT27Q7Z3Y8 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT27Q7Z3Y8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT27Q7Z3Y8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT27Q7Z3Y8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT27Q7Z3Y8 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT27Q7Z3Y8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT27Q7Z3Y8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT27Q7Z3Y8 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT27Q7Z3Y8 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT27Q7Z3Y8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT27Q7Z3Y8 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT27Q7Z3Y8 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT27Q7Z3Y8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT27Q7Z3Y8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT27Q7Z3Y8 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT27Q7Z3Y8 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT27Q7Z3Y8 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT27Q7Z3Y8 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT27Q7Z3Y8 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT27Q7Z3Y8 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT27Q7Z3Y8 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT27Q7Z3Y8 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT27Q7Z3Y8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT27Q7Z3Y8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT27Q7Z3Y8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT27Q7Z3Y8 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT27Q7Z3Y8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT27Q7Z3Y8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT27Q7Z3Y8 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT27Q7Z3Y8 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT27Q7Z3Y8 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT27Q7Z3Y8 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT27Q7Z3Y8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT27Q7Z3Y8 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT27Q7Z3Y8 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT27Q7Z3Y8 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT27Q7Z3Y8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT27Q7Z3Y8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT27Q7Z3Y8 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
KRT27Q7Z3Y8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT27Q7Z3Y8 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT27Q7Z3Y8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT27Q7Z3Y8 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT27Q7Z3Y8 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT27Q7Z3Y8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT27Q7Z3Y8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT27Q7Z3Y8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT27Q7Z3Y8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT27Q7Z3Y8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT27Q7Z3Y8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT27Q7Z3Y8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT27Q7Z3Y8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT27Q7Z3Y8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT27Q7Z3Y8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT27Q7Z3Y8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT27Q7Z3Y8 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT27Q7Z3Y8 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT27Q7Z3Y8 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT27Q7Z3Y8 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT27Q7Z3Y8 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT27Q7Z3Y8 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT27Q7Z3Y8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT27Q7Z3Y8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT27Q7Z3Y8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT27Q7Z3Y8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT27Q7Z3Y8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT27Q7Z3Y8 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms