Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms