Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB2

CXCL17, C-X-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL17Q6UXB2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CXCL17Q6UXB2 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CXCL17Q6UXB2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CXCL17Q6UXB2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CXCL17Q6UXB2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CXCL17Q6UXB2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CXCL17Q6UXB2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CXCL17Q6UXB2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CXCL17Q6UXB2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CXCL17Q6UXB2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CXCL17Q6UXB2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CXCL17Q6UXB2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CXCL17Q6UXB2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCL17Q6UXB2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCL17Q6UXB2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCL17Q6UXB2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCL17Q6UXB2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCL17Q6UXB2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCL17Q6UXB2 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCL17Q6UXB2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCL17Q6UXB2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCL17Q6UXB2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCL17Q6UXB2 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCL17Q6UXB2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCL17Q6UXB2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCL17Q6UXB2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCL17Q6UXB2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCL17Q6UXB2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCL17Q6UXB2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCL17Q6UXB2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCL17Q6UXB2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCL17Q6UXB2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCL17Q6UXB2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCL17Q6UXB2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCL17Q6UXB2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CXCL17Q6UXB2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CXCL17Q6UXB2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CXCL17Q6UXB2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CXCL17Q6UXB2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CXCL17Q6UXB2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CXCL17Q6UXB2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CXCL17Q6UXB2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms