Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms