Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
ZBED9Q6R2W3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
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