Protein–RNA interactions for Protein: Q6PI47

KCTD18, BTB/POZ domain-containing protein KCTD18, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD18Q6PI47 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCTD18Q6PI47 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms