Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTR9Q6PD62 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTR9Q6PD62 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTR9Q6PD62 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTR9Q6PD62 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTR9Q6PD62 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTR9Q6PD62 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTR9Q6PD62 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CTR9Q6PD62 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CTR9Q6PD62 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTR9Q6PD62 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTR9Q6PD62 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTR9Q6PD62 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTR9Q6PD62 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTR9Q6PD62 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTR9Q6PD62 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTR9Q6PD62 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTR9Q6PD62 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CTR9Q6PD62 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTR9Q6PD62 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTR9Q6PD62 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTR9Q6PD62 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTR9Q6PD62 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTR9Q6PD62 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTR9Q6PD62 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTR9Q6PD62 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTR9Q6PD62 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTR9Q6PD62 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTR9Q6PD62 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CTR9Q6PD62 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTR9Q6PD62 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTR9Q6PD62 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTR9Q6PD62 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTR9Q6PD62 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTR9Q6PD62 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTR9Q6PD62 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTR9Q6PD62 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTR9Q6PD62 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CTR9Q6PD62 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTR9Q6PD62 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTR9Q6PD62 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTR9Q6PD62 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms