Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGMBQ6NW40 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGMBQ6NW40 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGMBQ6NW40 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RGMBQ6NW40 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGMBQ6NW40 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGMBQ6NW40 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGMBQ6NW40 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGMBQ6NW40 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGMBQ6NW40 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGMBQ6NW40 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGMBQ6NW40 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGMBQ6NW40 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGMBQ6NW40 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGMBQ6NW40 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGMBQ6NW40 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGMBQ6NW40 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGMBQ6NW40 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGMBQ6NW40 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RGMBQ6NW40 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGMBQ6NW40 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGMBQ6NW40 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGMBQ6NW40 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGMBQ6NW40 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGMBQ6NW40 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RGMBQ6NW40 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGMBQ6NW40 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGMBQ6NW40 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGMBQ6NW40 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGMBQ6NW40 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGMBQ6NW40 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGMBQ6NW40 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGMBQ6NW40 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGMBQ6NW40 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGMBQ6NW40 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGMBQ6NW40 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGMBQ6NW40 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGMBQ6NW40 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGMBQ6NW40 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGMBQ6NW40 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGMBQ6NW40 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGMBQ6NW40 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGMBQ6NW40 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RGMBQ6NW40 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGMBQ6NW40 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGMBQ6NW40 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGMBQ6NW40 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGMBQ6NW40 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGMBQ6NW40 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGMBQ6NW40 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGMBQ6NW40 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGMBQ6NW40 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGMBQ6NW40 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGMBQ6NW40 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGMBQ6NW40 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RGMBQ6NW40 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGMBQ6NW40 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGMBQ6NW40 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGMBQ6NW40 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RGMBQ6NW40 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGMBQ6NW40 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGMBQ6NW40 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGMBQ6NW40 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGMBQ6NW40 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGMBQ6NW40 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGMBQ6NW40 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RGMBQ6NW40 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms