Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms