Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTE0

EEF1A1P5, Putative elongation factor 1-alpha-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P5Q5VTE0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms