Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q5VSD8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q5VSD8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q5VSD8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q5VSD8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q5VSD8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q5VSD8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q5VSD8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q5VSD8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q5VSD8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q5VSD8 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q5VSD8 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q5VSD8 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q5VSD8 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Q5VSD8 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Q5VSD8 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Q5VSD8 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q5VSD8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q5VSD8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q5VSD8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q5VSD8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q5VSD8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q5VSD8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q5VSD8 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q5VSD8 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q5VSD8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q5VSD8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q5VSD8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q5VSD8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q5VSD8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q5VSD8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q5VSD8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q5VSD8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q5VSD8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q5VSD8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q5VSD8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q5VSD8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q5VSD8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q5VSD8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q5VSD8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q5VSD8 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q5VSD8 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q5VSD8 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q5VSD8 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q5VSD8 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q5VSD8 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q5VSD8 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q5VSD8 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q5VSD8 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q5VSD8 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q5VSD8 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q5VSD8 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q5VSD8 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q5VSD8 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q5VSD8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q5VSD8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q5VSD8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q5VSD8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q5VSD8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q5VSD8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q5VSD8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q5VSD8 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q5VSD8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q5VSD8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q5VSD8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q5VSD8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q5VSD8 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q5VSD8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q5VSD8 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q5VSD8 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q5VSD8 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q5VSD8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q5VSD8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q5VSD8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q5VSD8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q5VSD8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q5VSD8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q5VSD8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q5VSD8 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q5VSD8 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q5VSD8 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q5VSD8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q5VSD8 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q5VSD8 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q5VSD8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Q5VSD8 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q5VSD8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q5VSD8 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q5VSD8 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q5VSD8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q5VSD8 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q5VSD8 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q5VSD8 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q5VSD8 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q5VSD8 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Q5VSD8 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q5VSD8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q5VSD8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q5VSD8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q5VSD8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms