Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NHSL1Q5SYE7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NHSL1Q5SYE7 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NHSL1Q5SYE7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NHSL1Q5SYE7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NHSL1Q5SYE7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NHSL1Q5SYE7 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NHSL1Q5SYE7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NHSL1Q5SYE7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NHSL1Q5SYE7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NHSL1Q5SYE7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NHSL1Q5SYE7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NHSL1Q5SYE7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NHSL1Q5SYE7 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NHSL1Q5SYE7 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NHSL1Q5SYE7 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NHSL1Q5SYE7 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NHSL1Q5SYE7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NHSL1Q5SYE7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NHSL1Q5SYE7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NHSL1Q5SYE7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NHSL1Q5SYE7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NHSL1Q5SYE7 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NHSL1Q5SYE7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NHSL1Q5SYE7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NHSL1Q5SYE7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NHSL1Q5SYE7 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NHSL1Q5SYE7 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
NHSL1Q5SYE7 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NHSL1Q5SYE7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NHSL1Q5SYE7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NHSL1Q5SYE7 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NHSL1Q5SYE7 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NHSL1Q5SYE7 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NHSL1Q5SYE7 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NHSL1Q5SYE7 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NHSL1Q5SYE7 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NHSL1Q5SYE7 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NHSL1Q5SYE7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NHSL1Q5SYE7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NHSL1Q5SYE7 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NHSL1Q5SYE7 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NHSL1Q5SYE7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NHSL1Q5SYE7 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NHSL1Q5SYE7 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NHSL1Q5SYE7 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NHSL1Q5SYE7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NHSL1Q5SYE7 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NHSL1Q5SYE7 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
NHSL1Q5SYE7 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NHSL1Q5SYE7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NHSL1Q5SYE7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NHSL1Q5SYE7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NHSL1Q5SYE7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NHSL1Q5SYE7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NHSL1Q5SYE7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NHSL1Q5SYE7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NHSL1Q5SYE7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NHSL1Q5SYE7 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NHSL1Q5SYE7 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NHSL1Q5SYE7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NHSL1Q5SYE7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NHSL1Q5SYE7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NHSL1Q5SYE7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NHSL1Q5SYE7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NHSL1Q5SYE7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NHSL1Q5SYE7 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NHSL1Q5SYE7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NHSL1Q5SYE7 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NHSL1Q5SYE7 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NHSL1Q5SYE7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NHSL1Q5SYE7 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NHSL1Q5SYE7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NHSL1Q5SYE7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NHSL1Q5SYE7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NHSL1Q5SYE7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NHSL1Q5SYE7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NHSL1Q5SYE7 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NHSL1Q5SYE7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NHSL1Q5SYE7 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NHSL1Q5SYE7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NHSL1Q5SYE7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NHSL1Q5SYE7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NHSL1Q5SYE7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NHSL1Q5SYE7 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NHSL1Q5SYE7 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NHSL1Q5SYE7 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NHSL1Q5SYE7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NHSL1Q5SYE7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NHSL1Q5SYE7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NHSL1Q5SYE7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NHSL1Q5SYE7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NHSL1Q5SYE7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NHSL1Q5SYE7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NHSL1Q5SYE7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NHSL1Q5SYE7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NHSL1Q5SYE7 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NHSL1Q5SYE7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NHSL1Q5SYE7 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NHSL1Q5SYE7 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms