Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQC4

CT47A1, Cancer/testis antigen 47A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47A1Q5JQC4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CT47A1Q5JQC4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms