Protein–RNA interactions for Protein: Q49MI3

CERKL, Ceramide kinase-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERKLQ49MI3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms