Protein–RNA interactions for Protein: Q3LFD5

USP41, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 41, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41Q3LFD5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP41Q3LFD5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP41Q3LFD5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP41Q3LFD5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP41Q3LFD5 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP41Q3LFD5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP41Q3LFD5 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP41Q3LFD5 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP41Q3LFD5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP41Q3LFD5 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP41Q3LFD5 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP41Q3LFD5 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP41Q3LFD5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP41Q3LFD5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP41Q3LFD5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP41Q3LFD5 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP41Q3LFD5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP41Q3LFD5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
USP41Q3LFD5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP41Q3LFD5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP41Q3LFD5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP41Q3LFD5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP41Q3LFD5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP41Q3LFD5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP41Q3LFD5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP41Q3LFD5 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP41Q3LFD5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP41Q3LFD5 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP41Q3LFD5 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP41Q3LFD5 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP41Q3LFD5 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP41Q3LFD5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP41Q3LFD5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP41Q3LFD5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP41Q3LFD5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP41Q3LFD5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP41Q3LFD5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP41Q3LFD5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP41Q3LFD5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP41Q3LFD5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP41Q3LFD5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP41Q3LFD5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP41Q3LFD5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP41Q3LFD5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP41Q3LFD5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP41Q3LFD5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP41Q3LFD5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP41Q3LFD5 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP41Q3LFD5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP41Q3LFD5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP41Q3LFD5 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
USP41Q3LFD5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP41Q3LFD5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP41Q3LFD5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP41Q3LFD5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP41Q3LFD5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP41Q3LFD5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP41Q3LFD5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
USP41Q3LFD5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP41Q3LFD5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP41Q3LFD5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP41Q3LFD5 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP41Q3LFD5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP41Q3LFD5 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP41Q3LFD5 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP41Q3LFD5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP41Q3LFD5 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP41Q3LFD5 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
USP41Q3LFD5 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
USP41Q3LFD5 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP41Q3LFD5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP41Q3LFD5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22■■□□□ 1.11
USP41Q3LFD5 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms