Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RTL8BQ17RB0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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