Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
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