Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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