Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA6Q16445 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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