Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
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