Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEC23BQ15437 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEC23BQ15437 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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SEC23BQ15437 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEC23BQ15437 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEC23BQ15437 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEC23BQ15437 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEC23BQ15437 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEC23BQ15437 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEC23BQ15437 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEC23BQ15437 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEC23BQ15437 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEC23BQ15437 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEC23BQ15437 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEC23BQ15437 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEC23BQ15437 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEC23BQ15437 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEC23BQ15437 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEC23BQ15437 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEC23BQ15437 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEC23BQ15437 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEC23BQ15437 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEC23BQ15437 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEC23BQ15437 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEC23BQ15437 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEC23BQ15437 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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