Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms