Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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