Protein–RNA interactions for Protein: Q14690

PDCD11, Protein RRP5 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,871 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD11Q14690 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
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