Protein–RNA interactions for Protein: Q14653

IRF3, Interferon regulatory factor 3, humanhuman

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Length 427 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF3Q14653 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF3Q14653 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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