Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
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