Protein–RNA interactions for Protein: Q13901

C1D, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1DQ13901 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C1DQ13901 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C1DQ13901 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C1DQ13901 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C1DQ13901 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C1DQ13901 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C1DQ13901 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C1DQ13901 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C1DQ13901 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C1DQ13901 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C1DQ13901 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C1DQ13901 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C1DQ13901 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C1DQ13901 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C1DQ13901 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C1DQ13901 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C1DQ13901 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C1DQ13901 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C1DQ13901 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C1DQ13901 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C1DQ13901 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C1DQ13901 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C1DQ13901 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C1DQ13901 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C1DQ13901 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C1DQ13901 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C1DQ13901 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C1DQ13901 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C1DQ13901 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C1DQ13901 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C1DQ13901 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C1DQ13901 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C1DQ13901 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C1DQ13901 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C1DQ13901 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C1DQ13901 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C1DQ13901 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C1DQ13901 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C1DQ13901 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C1DQ13901 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C1DQ13901 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C1DQ13901 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C1DQ13901 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C1DQ13901 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
C1DQ13901 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C1DQ13901 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
C1DQ13901 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
C1DQ13901 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
C1DQ13901 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
C1DQ13901 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C1DQ13901 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C1DQ13901 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
C1DQ13901 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C1DQ13901 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C1DQ13901 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C1DQ13901 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C1DQ13901 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C1DQ13901 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C1DQ13901 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C1DQ13901 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C1DQ13901 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C1DQ13901 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C1DQ13901 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C1DQ13901 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C1DQ13901 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C1DQ13901 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C1DQ13901 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C1DQ13901 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C1DQ13901 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C1DQ13901 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C1DQ13901 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C1DQ13901 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19■□□□□ 0.63
C1DQ13901 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19■□□□□ 0.63
C1DQ13901 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C1DQ13901 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
C1DQ13901 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
C1DQ13901 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
C1DQ13901 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C1DQ13901 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
C1DQ13901 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C1DQ13901 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C1DQ13901 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
C1DQ13901 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C1DQ13901 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
C1DQ13901 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
C1DQ13901 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19■□□□□ 0.63
C1DQ13901 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
C1DQ13901 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C1DQ13901 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
C1DQ13901 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C1DQ13901 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C1DQ13901 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C1DQ13901 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C1DQ13901 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C1DQ13901 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C1DQ13901 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
C1DQ13901 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C1DQ13901 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C1DQ13901 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C1DQ13901 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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