Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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