Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms