Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

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Length 620 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CDC16Q13042 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDC16Q13042 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDC16Q13042 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDC16Q13042 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDC16Q13042 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDC16Q13042 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDC16Q13042 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDC16Q13042 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDC16Q13042 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CDC16Q13042 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDC16Q13042 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDC16Q13042 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDC16Q13042 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDC16Q13042 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDC16Q13042 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDC16Q13042 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CDC16Q13042 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDC16Q13042 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDC16Q13042 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDC16Q13042 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDC16Q13042 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDC16Q13042 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDC16Q13042 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDC16Q13042 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDC16Q13042 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDC16Q13042 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDC16Q13042 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDC16Q13042 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDC16Q13042 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDC16Q13042 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDC16Q13042 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDC16Q13042 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDC16Q13042 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDC16Q13042 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDC16Q13042 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDC16Q13042 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDC16Q13042 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDC16Q13042 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDC16Q13042 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDC16Q13042 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
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