Protein–RNA interactions for Protein: Q03692

COL10A1, Collagen alpha-1(X) chain, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL10A1Q03692 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL10A1Q03692 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL10A1Q03692 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL10A1Q03692 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL10A1Q03692 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL10A1Q03692 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL10A1Q03692 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL10A1Q03692 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL10A1Q03692 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL10A1Q03692 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL10A1Q03692 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL10A1Q03692 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL10A1Q03692 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL10A1Q03692 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL10A1Q03692 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL10A1Q03692 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL10A1Q03692 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
COL10A1Q03692 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
COL10A1Q03692 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
COL10A1Q03692 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
COL10A1Q03692 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL10A1Q03692 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms