Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms