Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CLTCQ00610 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CLTCQ00610 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CLTCQ00610 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CLTCQ00610 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CLTCQ00610 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CLTCQ00610 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CLTCQ00610 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CLTCQ00610 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CLTCQ00610 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CLTCQ00610 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CLTCQ00610 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CLTCQ00610 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CLTCQ00610 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CLTCQ00610 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CLTCQ00610 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CLTCQ00610 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CLTCQ00610 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CLTCQ00610 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CLTCQ00610 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CLTCQ00610 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CLTCQ00610 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CLTCQ00610 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CLTCQ00610 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CLTCQ00610 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.46
CLTCQ00610 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC30.45■■■□□ 2.46
CLTCQ00610 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CLTCQ00610 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CLTCQ00610 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CLTCQ00610 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CLTCQ00610 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CLTCQ00610 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CLTCQ00610 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CLTCQ00610 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CLTCQ00610 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CLTCQ00610 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CLTCQ00610 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CLTCQ00610 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CLTCQ00610 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CLTCQ00610 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CLTCQ00610 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CLTCQ00610 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CLTCQ00610 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CLTCQ00610 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CLTCQ00610 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CLTCQ00610 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CLTCQ00610 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CLTCQ00610 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CLTCQ00610 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CLTCQ00610 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CLTCQ00610 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CLTCQ00610 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CLTCQ00610 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CLTCQ00610 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
CLTCQ00610 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CLTCQ00610 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CLTCQ00610 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CLTCQ00610 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CLTCQ00610 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CLTCQ00610 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CLTCQ00610 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CLTCQ00610 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CLTCQ00610 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
CLTCQ00610 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CLTCQ00610 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CLTCQ00610 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CLTCQ00610 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CLTCQ00610 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CLTCQ00610 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CLTCQ00610 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CLTCQ00610 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CLTCQ00610 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CLTCQ00610 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CLTCQ00610 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CLTCQ00610 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
CLTCQ00610 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CLTCQ00610 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CLTCQ00610 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CLTCQ00610 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CLTCQ00610 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
CLTCQ00610 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
CLTCQ00610 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CLTCQ00610 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CLTCQ00610 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CLTCQ00610 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CLTCQ00610 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CLTCQ00610 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CLTCQ00610 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.45
CLTCQ00610 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
CLTCQ00610 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC30.39■■■□□ 2.45
CLTCQ00610 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
CLTCQ00610 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CLTCQ00610 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CLTCQ00610 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CLTCQ00610 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CLTCQ00610 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CLTCQ00610 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CLTCQ00610 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CLTCQ00610 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CLTCQ00610 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms