Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBX1P83916 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBX1P83916 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBX1P83916 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBX1P83916 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBX1P83916 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBX1P83916 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBX1P83916 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBX1P83916 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBX1P83916 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CBX1P83916 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBX1P83916 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBX1P83916 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBX1P83916 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBX1P83916 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBX1P83916 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBX1P83916 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBX1P83916 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBX1P83916 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBX1P83916 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBX1P83916 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBX1P83916 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBX1P83916 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBX1P83916 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CBX1P83916 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CBX1P83916 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CBX1P83916 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CBX1P83916 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CBX1P83916 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CBX1P83916 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CBX1P83916 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CBX1P83916 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CBX1P83916 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CBX1P83916 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CBX1P83916 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CBX1P83916 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CBX1P83916 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CBX1P83916 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CBX1P83916 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CBX1P83916 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CBX1P83916 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CBX1P83916 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CBX1P83916 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CBX1P83916 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CBX1P83916 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CBX1P83916 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CBX1P83916 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CBX1P83916 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CBX1P83916 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CBX1P83916 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CBX1P83916 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CBX1P83916 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CBX1P83916 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CBX1P83916 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CBX1P83916 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CBX1P83916 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CBX1P83916 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CBX1P83916 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBX1P83916 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBX1P83916 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBX1P83916 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBX1P83916 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBX1P83916 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBX1P83916 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBX1P83916 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBX1P83916 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBX1P83916 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CBX1P83916 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CBX1P83916 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CBX1P83916 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CBX1P83916 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CBX1P83916 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CBX1P83916 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CBX1P83916 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CBX1P83916 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CBX1P83916 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CBX1P83916 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CBX1P83916 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CBX1P83916 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CBX1P83916 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CBX1P83916 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CBX1P83916 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CBX1P83916 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CBX1P83916 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CBX1P83916 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CBX1P83916 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CBX1P83916 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CBX1P83916 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CBX1P83916 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CBX1P83916 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CBX1P83916 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CBX1P83916 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CBX1P83916 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CBX1P83916 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CBX1P83916 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBX1P83916 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBX1P83916 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBX1P83916 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBX1P83916 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBX1P83916 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms