Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms