Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP6P55212 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP6P55212 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP6P55212 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP6P55212 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP6P55212 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP6P55212 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP6P55212 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP6P55212 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP6P55212 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP6P55212 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP6P55212 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP6P55212 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP6P55212 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP6P55212 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP6P55212 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP6P55212 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP6P55212 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP6P55212 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP6P55212 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP6P55212 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP6P55212 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP6P55212 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP6P55212 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP6P55212 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP6P55212 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP6P55212 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP6P55212 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP6P55212 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP6P55212 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP6P55212 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP6P55212 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP6P55212 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP6P55212 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP6P55212 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP6P55212 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP6P55212 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP6P55212 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP6P55212 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP6P55212 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP6P55212 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP6P55212 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP6P55212 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP6P55212 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP6P55212 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP6P55212 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP6P55212 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP6P55212 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP6P55212 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP6P55212 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP6P55212 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP6P55212 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP6P55212 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP6P55212 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP6P55212 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP6P55212 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP6P55212 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP6P55212 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP6P55212 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP6P55212 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP6P55212 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP6P55212 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP6P55212 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP6P55212 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP6P55212 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP6P55212 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP6P55212 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP6P55212 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP6P55212 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP6P55212 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP6P55212 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP6P55212 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP6P55212 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP6P55212 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP6P55212 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP6P55212 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP6P55212 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP6P55212 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP6P55212 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP6P55212 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP6P55212 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP6P55212 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP6P55212 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP6P55212 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP6P55212 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP6P55212 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP6P55212 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP6P55212 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CASP6P55212 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CASP6P55212 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CASP6P55212 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP6P55212 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP6P55212 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP6P55212 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP6P55212 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP6P55212 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP6P55212 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP6P55212 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP6P55212 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP6P55212 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms