Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms