Protein–RNA interactions for Protein: P52742

ZNF135, Zinc finger protein 135, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF135P52742 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF135P52742 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF135P52742 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF135P52742 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF135P52742 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF135P52742 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF135P52742 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF135P52742 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF135P52742 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF135P52742 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF135P52742 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF135P52742 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF135P52742 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF135P52742 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF135P52742 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF135P52742 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF135P52742 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF135P52742 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF135P52742 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF135P52742 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF135P52742 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF135P52742 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ZNF135P52742 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF135P52742 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF135P52742 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF135P52742 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms