Protein–RNA interactions for Protein: P47914

RPL29, 60S ribosomal protein L29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL29P47914 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL29P47914 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL29P47914 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL29P47914 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL29P47914 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL29P47914 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL29P47914 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL29P47914 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL29P47914 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL29P47914 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL29P47914 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL29P47914 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL29P47914 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL29P47914 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL29P47914 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL29P47914 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL29P47914 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL29P47914 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL29P47914 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL29P47914 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL29P47914 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL29P47914 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL29P47914 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL29P47914 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL29P47914 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL29P47914 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL29P47914 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL29P47914 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL29P47914 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL29P47914 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL29P47914 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL29P47914 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL29P47914 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL29P47914 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL29P47914 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL29P47914 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL29P47914 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL29P47914 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL29P47914 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL29P47914 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL29P47914 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL29P47914 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL29P47914 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL29P47914 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL29P47914 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL29P47914 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL29P47914 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL29P47914 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL29P47914 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL29P47914 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL29P47914 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL29P47914 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL29P47914 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL29P47914 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL29P47914 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL29P47914 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL29P47914 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL29P47914 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL29P47914 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL29P47914 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL29P47914 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL29P47914 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL29P47914 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL29P47914 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL29P47914 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL29P47914 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL29P47914 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL29P47914 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL29P47914 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL29P47914 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL29P47914 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL29P47914 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL29P47914 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL29P47914 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL29P47914 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL29P47914 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL29P47914 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL29P47914 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL29P47914 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL29P47914 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL29P47914 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL29P47914 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL29P47914 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL29P47914 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL29P47914 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL29P47914 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL29P47914 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL29P47914 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL29P47914 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL29P47914 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL29P47914 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL29P47914 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL29P47914 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL29P47914 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL29P47914 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL29P47914 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL29P47914 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL29P47914 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL29P47914 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL29P47914 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms