Protein–RNA interactions for Protein: P43351

RAD52, DNA repair protein RAD52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD52P43351 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD52P43351 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD52P43351 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD52P43351 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD52P43351 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD52P43351 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD52P43351 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD52P43351 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD52P43351 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD52P43351 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD52P43351 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD52P43351 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD52P43351 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD52P43351 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD52P43351 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD52P43351 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD52P43351 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD52P43351 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD52P43351 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD52P43351 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD52P43351 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD52P43351 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD52P43351 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD52P43351 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD52P43351 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD52P43351 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD52P43351 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD52P43351 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAD52P43351 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAD52P43351 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAD52P43351 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAD52P43351 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAD52P43351 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAD52P43351 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAD52P43351 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RAD52P43351 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAD52P43351 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAD52P43351 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAD52P43351 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RAD52P43351 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAD52P43351 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAD52P43351 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAD52P43351 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAD52P43351 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RAD52P43351 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAD52P43351 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAD52P43351 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAD52P43351 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAD52P43351 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAD52P43351 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAD52P43351 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAD52P43351 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAD52P43351 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAD52P43351 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAD52P43351 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAD52P43351 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAD52P43351 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD52P43351 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD52P43351 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD52P43351 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD52P43351 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD52P43351 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD52P43351 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD52P43351 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD52P43351 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD52P43351 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD52P43351 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD52P43351 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD52P43351 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD52P43351 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD52P43351 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD52P43351 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD52P43351 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD52P43351 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD52P43351 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD52P43351 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD52P43351 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD52P43351 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD52P43351 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD52P43351 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD52P43351 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD52P43351 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD52P43351 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD52P43351 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD52P43351 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD52P43351 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD52P43351 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD52P43351 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD52P43351 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD52P43351 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD52P43351 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD52P43351 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD52P43351 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD52P43351 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD52P43351 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD52P43351 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD52P43351 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD52P43351 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD52P43351 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD52P43351 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms