Protein–RNA interactions for Protein: P38935

IGHMBP2, DNA-binding protein SMUBP-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHMBP2P38935 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
IGHMBP2P38935 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms