Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BMI1P35226 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BMI1P35226 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BMI1P35226 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BMI1P35226 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BMI1P35226 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BMI1P35226 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BMI1P35226 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BMI1P35226 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BMI1P35226 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BMI1P35226 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BMI1P35226 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BMI1P35226 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BMI1P35226 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BMI1P35226 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BMI1P35226 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BMI1P35226 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BMI1P35226 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BMI1P35226 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BMI1P35226 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BMI1P35226 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BMI1P35226 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BMI1P35226 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BMI1P35226 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BMI1P35226 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BMI1P35226 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BMI1P35226 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BMI1P35226 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BMI1P35226 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BMI1P35226 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BMI1P35226 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BMI1P35226 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BMI1P35226 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BMI1P35226 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BMI1P35226 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BMI1P35226 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BMI1P35226 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BMI1P35226 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BMI1P35226 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BMI1P35226 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BMI1P35226 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BMI1P35226 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BMI1P35226 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BMI1P35226 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BMI1P35226 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BMI1P35226 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BMI1P35226 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BMI1P35226 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BMI1P35226 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BMI1P35226 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BMI1P35226 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BMI1P35226 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BMI1P35226 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BMI1P35226 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BMI1P35226 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BMI1P35226 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BMI1P35226 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BMI1P35226 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BMI1P35226 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BMI1P35226 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BMI1P35226 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BMI1P35226 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BMI1P35226 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BMI1P35226 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BMI1P35226 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BMI1P35226 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BMI1P35226 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BMI1P35226 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BMI1P35226 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BMI1P35226 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BMI1P35226 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BMI1P35226 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BMI1P35226 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BMI1P35226 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BMI1P35226 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BMI1P35226 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BMI1P35226 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BMI1P35226 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BMI1P35226 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BMI1P35226 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BMI1P35226 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BMI1P35226 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BMI1P35226 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BMI1P35226 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BMI1P35226 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BMI1P35226 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BMI1P35226 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BMI1P35226 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BMI1P35226 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BMI1P35226 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BMI1P35226 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BMI1P35226 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BMI1P35226 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BMI1P35226 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BMI1P35226 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BMI1P35226 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BMI1P35226 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BMI1P35226 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BMI1P35226 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BMI1P35226 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms