Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNA1P35221 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNA1P35221 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNA1P35221 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNA1P35221 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNA1P35221 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNA1P35221 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNA1P35221 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNA1P35221 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNA1P35221 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNA1P35221 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNA1P35221 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNA1P35221 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNA1P35221 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNA1P35221 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNA1P35221 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNA1P35221 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNA1P35221 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNA1P35221 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNA1P35221 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNA1P35221 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNA1P35221 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNA1P35221 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNA1P35221 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNA1P35221 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNA1P35221 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNA1P35221 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNA1P35221 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNA1P35221 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNA1P35221 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNA1P35221 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNA1P35221 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNA1P35221 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNA1P35221 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNA1P35221 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNA1P35221 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CTNNA1P35221 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA1P35221 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA1P35221 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA1P35221 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA1P35221 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA1P35221 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA1P35221 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA1P35221 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA1P35221 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA1P35221 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA1P35221 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA1P35221 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA1P35221 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA1P35221 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA1P35221 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA1P35221 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA1P35221 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA1P35221 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA1P35221 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA1P35221 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA1P35221 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA1P35221 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA1P35221 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA1P35221 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA1P35221 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA1P35221 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA1P35221 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA1P35221 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA1P35221 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNA1P35221 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNA1P35221 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNA1P35221 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNA1P35221 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNA1P35221 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNA1P35221 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNA1P35221 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNA1P35221 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNA1P35221 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNA1P35221 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNA1P35221 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNA1P35221 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNA1P35221 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNA1P35221 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNA1P35221 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNNA1P35221 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNNA1P35221 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNNA1P35221 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNNA1P35221 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNNA1P35221 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNNA1P35221 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNNA1P35221 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNNA1P35221 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNNA1P35221 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNNA1P35221 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNNA1P35221 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNNA1P35221 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNNA1P35221 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNNA1P35221 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNNA1P35221 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNNA1P35221 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNNA1P35221 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNNA1P35221 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNNA1P35221 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTNNA1P35221 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms