Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms