Protein–RNA interactions for Protein: P18848

ATF4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF4P18848 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATF4P18848 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATF4P18848 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATF4P18848 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATF4P18848 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATF4P18848 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATF4P18848 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATF4P18848 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATF4P18848 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATF4P18848 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATF4P18848 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATF4P18848 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATF4P18848 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATF4P18848 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATF4P18848 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ATF4P18848 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATF4P18848 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATF4P18848 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATF4P18848 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATF4P18848 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATF4P18848 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATF4P18848 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATF4P18848 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATF4P18848 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATF4P18848 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATF4P18848 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATF4P18848 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATF4P18848 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATF4P18848 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATF4P18848 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATF4P18848 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATF4P18848 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATF4P18848 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATF4P18848 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATF4P18848 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATF4P18848 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATF4P18848 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATF4P18848 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATF4P18848 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATF4P18848 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATF4P18848 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATF4P18848 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATF4P18848 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATF4P18848 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATF4P18848 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATF4P18848 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATF4P18848 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATF4P18848 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATF4P18848 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATF4P18848 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATF4P18848 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATF4P18848 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATF4P18848 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATF4P18848 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATF4P18848 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATF4P18848 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATF4P18848 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATF4P18848 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATF4P18848 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATF4P18848 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATF4P18848 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATF4P18848 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATF4P18848 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATF4P18848 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATF4P18848 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATF4P18848 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATF4P18848 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATF4P18848 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATF4P18848 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATF4P18848 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATF4P18848 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATF4P18848 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATF4P18848 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATF4P18848 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATF4P18848 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATF4P18848 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATF4P18848 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATF4P18848 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATF4P18848 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATF4P18848 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATF4P18848 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATF4P18848 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATF4P18848 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATF4P18848 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATF4P18848 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATF4P18848 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATF4P18848 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATF4P18848 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATF4P18848 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATF4P18848 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATF4P18848 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATF4P18848 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATF4P18848 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATF4P18848 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATF4P18848 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATF4P18848 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATF4P18848 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATF4P18848 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATF4P18848 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATF4P18848 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms