Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYN1P17600 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYN1P17600 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYN1P17600 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYN1P17600 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYN1P17600 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYN1P17600 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYN1P17600 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYN1P17600 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYN1P17600 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYN1P17600 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYN1P17600 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYN1P17600 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYN1P17600 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYN1P17600 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYN1P17600 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYN1P17600 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYN1P17600 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYN1P17600 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYN1P17600 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SYN1P17600 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYN1P17600 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYN1P17600 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYN1P17600 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYN1P17600 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYN1P17600 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SYN1P17600 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYN1P17600 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYN1P17600 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYN1P17600 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYN1P17600 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYN1P17600 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SYN1P17600 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYN1P17600 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYN1P17600 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYN1P17600 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYN1P17600 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SYN1P17600 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYN1P17600 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYN1P17600 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYN1P17600 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYN1P17600 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SYN1P17600 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYN1P17600 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYN1P17600 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYN1P17600 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYN1P17600 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYN1P17600 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYN1P17600 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SYN1P17600 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYN1P17600 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYN1P17600 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SYN1P17600 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYN1P17600 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYN1P17600 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYN1P17600 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYN1P17600 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYN1P17600 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYN1P17600 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYN1P17600 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYN1P17600 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYN1P17600 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYN1P17600 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYN1P17600 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYN1P17600 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYN1P17600 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYN1P17600 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYN1P17600 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYN1P17600 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYN1P17600 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SYN1P17600 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYN1P17600 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYN1P17600 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYN1P17600 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYN1P17600 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYN1P17600 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYN1P17600 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYN1P17600 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYN1P17600 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYN1P17600 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYN1P17600 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYN1P17600 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYN1P17600 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYN1P17600 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYN1P17600 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYN1P17600 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYN1P17600 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYN1P17600 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SYN1P17600 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYN1P17600 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYN1P17600 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYN1P17600 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYN1P17600 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYN1P17600 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYN1P17600 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYN1P17600 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYN1P17600 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYN1P17600 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYN1P17600 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SYN1P17600 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms